מגמת הנדסת מערכות הינה ייחודית ויוקרתית בה לומדים התלמידים 2 מקצועות:
מקצוע מוביל – בקרת מערכות הנדסיות ומקצוע התמחות – מכטרוניקה.
כל מקצוע בהיקף של 5 יח"ל. במקצוע המוביל נלמדים נושאי ליבה של הנדסת מכונות וכן שרטוט בתלת מימד, בתוכנה הבינלאומית SOLIDWORKS .
המגמה תורמת רבות לפיתוח החשיבה וההבנה של התלמיד.
מקצוע ההתמחות מבוסס על פרויקט בד"כ תחרות הרובוטיקה העולמית של ה-FRC בה משתתפות הבנות בבניית רובוט תחרותי וכתיבת עבודת גמר על תהליך הבנייה.

